扩展熊猫#

虽然 pandas 提供了丰富的方法、容器和数据类型,但您的需求可能无法完全满足。 pandas 提供了一些扩展 pandas 的选项。

注册自定义访问器#

库可以使用装饰器 pandas.api.extensions.register_dataframe_accessor()pandas.api.extensions.register_series_accessor()、 和 pandas.api.extensions.register_index_accessor()来向 pandas 对象添加额外的“命名空间”。所有这些都遵循类似的约定:您装饰一个类,提供要添加的属性的名称。类的 __init__方法获取被装饰的对象。例如:

@pd.api.extensions.register_dataframe_accessor("geo")
class GeoAccessor:
    def __init__(self, pandas_obj):
        self._validate(pandas_obj)
        self._obj = pandas_obj

    @staticmethod
    def _validate(obj):
        # verify there is a column latitude and a column longitude
        if "latitude" not in obj.columns or "longitude" not in obj.columns:
            raise AttributeError("Must have 'latitude' and 'longitude'.")

    @property
    def center(self):
        # return the geographic center point of this DataFrame
        lat = self._obj.latitude
        lon = self._obj.longitude
        return (float(lon.mean()), float(lat.mean()))

    def plot(self):
        # plot this array's data on a map, e.g., using Cartopy
        pass

现在用户可以使用geo命名空间访问您的方法:

>>> ds = pd.DataFrame(
...     {"longitude": np.linspace(0, 10), "latitude": np.linspace(0, 20)}
... )
>>> ds.geo.center
(5.0, 10.0)
>>> ds.geo.plot()
# plots data on a map

这是扩展 pandas 对象而无需子类化它们的便捷方法。如果您编写自定义访问器,请发出拉取请求,将其添加到我们的 生态系统页面。

我们强烈建议您验证访问者的__init__.在我们的 中GeoAccessor,我们验证数据是否包含预期的列,并AttributeError在验证失败时引发 。对于Series访问器,您应该验证dtype访问器是否仅适用于某些数据类型。

扩展类型#

笔记

pandas.api.extensions.ExtensionDtype和APIpandas.api.extensions.ExtensionArray在 pandas 1.5 之前是实验性的。从 1.5 版本开始,未来的更改将遵循pandas 弃用政策

pandas 定义了一个接口,用于实现扩展 NumPy 类型系统的数据类型和数组。 pandas 本身使用 NumPy 中未内置的某些类型的扩展系统(分类、周期、间隔、带时区的日期时间)。

库可以定义自定义数组和数据类型。当pandas遇到这些对象时,它们将被正确处理(即不转换为对象的ndarray)。许多方法(例如)pandas.isna()将分派到扩展类型的实现。

如果您正在构建一个实现该接口的库,请在生态系统页面上公开它。

该接口由两个类组成。

ExtensionDtype#

Apandas.api.extensions.ExtensionDtype类似于一个numpy.dtype对象。它描述了数据类型。实施者负责一些独特的项目,例如名称。

一项特别重要的项目是type财产。这应该是数据标量类型的类。例如,如果您正在为 IP 地址数据编写扩展数组,则这可能是ipaddress.IPv4Address.

有关接口定义,请参阅扩展 dtype 源。

pandas.api.extensions.ExtensionDtype可以注册到 pandas 以允许通过字符串数据类型名称进行创建。这允许人们实例化Series并使用注册的字符串.astype()名称,例如.'category'CategoricalDtype

有关如何注册 dtype 的更多信息,请参阅扩展 dtype dtypes 。

ExtensionArray#

此类提供所有类似数组的功能。 ExtensionArray 仅限于一维。 ExtensionArray 通过 dtype属性链接到 ExtensionDtype。

__new__pandas 对如何通过或创建扩展数组没有任何限制 __init__,并且对如何存储数据没有限制。我们确实要求您的数组可转换为 NumPy 数组,即使这相对昂贵(因为它是Categorical)。

它们可能不受、一个或多个 NumPy 数组的支持。例如, pandas.Categorical是一个由两个数组支持的扩展数组,一个用于代码,一个用于类别。 IPv6 地址数组可以由具有两个字段的 NumPy 结构数组支持,一个用于低 64 位,一个用于高 64 位。或者它们可能由其他一些存储类型支持,例如 Python 列表。

有关接口定义,请参阅扩展数组源。文档字符串和注释包含正确实现接口的指南。

ExtensionArray运营商支持#

默认情况下,没有为该类定义任何运算符ExtensionArray。有两种方法可以为 ExtensionArray 提供操作员支持:

  1. 定义子类中的每个运算符ExtensionArray

  2. 使用 pandas 的运算符实现,该实现依赖于已在 ExtensionArray 的基础元素(标量)上定义的运算符。

笔记

无论采用哪种方法,您可能需要设置__array_priority__ 是否希望在涉及 NumPy 数组的二进制运算时调用您的实现。

对于第一种方法,您定义您希望子类支持的选定运算符,例如__add__、等。__le__ExtensionArray

第二种方法假设 的底层元素(即标量类型)ExtensionArray 已经定义了各个运算符。换句话说,如果您的ExtensionArray 命名MyExtensionArray实现为每个元素都是类的实例MyExtensionElement,那么如果为 定义运算符MyExtensionElement,则第二种方法将自动为 定义运算符MyExtensionArray

mixin 类ExtensionScalarOpsMixin支持第二种方法。ExtensionArray例如,如果开发子类MyExtensionArray,可以简单地将 包含ExtensionScalarOpsMixin为 的父类MyExtensionArray,然后调用方法_add_arithmetic_ops()和/或 _add_comparison_ops()将运算符挂接到您的MyExtensionArray类中,如下所示:

from pandas.api.extensions import ExtensionArray, ExtensionScalarOpsMixin


class MyExtensionArray(ExtensionArray, ExtensionScalarOpsMixin):
    pass


MyExtensionArray._add_arithmetic_ops()
MyExtensionArray._add_comparison_ops()

笔记

由于pandas自动逐一调用每个元素上的底层运算符,因此这可能不如直接在ExtensionArray.

对于算术运算,此实现将尝试使用 ExtensionArray逐元素运算的结果重建一个新的。是否成功取决于操作是否返回对ExtensionArray.如果ExtensionArray无法重建,则返回包含标量的 ndarray。

为了易于实现并与 pandas 和 NumPy ndarray 之间的操作保持一致,我们建议不要在二进制操作中处理系列和索引。相反,您应该检测这些情况并返回NotImplemented。当pandas遇到像这样的操作时,pandas会op(Series, ExtensionArray)

  1. Series从( Series.array)中取消数组装箱

  2. 称呼result = op(values, ExtensionArray)

  3. 将结果重新装箱Series

NumPy 通用函数#

Series实现__array_ufunc__.作为实现的一部分,pandas 从ExtensionArray中拆箱Series,应用 ufunc,并在必要时重新装箱。

如果适用,我们强烈建议您__array_ufunc__在扩展数组中实现以避免强制 ndarray。 有关示例,请参阅 NumPy 文档。

作为实施的一部分,我们要求您在 中检测到 pandas 容器(SeriesDataFrameIndex)时遵循 pandas inputs。如果存在其中任何一个,您应该返回NotImplemented。 pandas 将负责从容器中拆箱数组,并使用拆开的输入重新调用 ufunc。

测试扩展数组#

我们提供了一个测试套件,以确保您的扩展阵列满足预期的行为。要使用测试套件,您必须提供几个 pytest 固定装置并从基本测试类继承。所需的装置可在 pandas-dev/pandas中找到。

要使用测试,请将其子类化:

from pandas.tests.extension import base


class TestConstructors(base.BaseConstructorsTests):
    pass

有关所有可用测试的列表,请参阅pandas-dev/pandas 。

与 Apache Arrow 的兼容性#

AnExtensionArray可以通过实现两种方法来支持与数组之间的转换pyarrow(从而支持例如序列化为 Parquet 文件格式):ExtensionArray.__arrow_array__ExtensionDtype.__from_arrow__

确保ExtensionArray.__arrow_array__知道pyarrow如何将特定扩展数组转换为pyarrow.Array(也作为 pandas DataFrame 中的列包含时):

class MyExtensionArray(ExtensionArray):
    ...

    def __arrow_array__(self, type=None):
        # convert the underlying array values to a pyarrow Array
        import pyarrow

        return pyarrow.array(..., type=type)

然后该ExtensionDtype.__from_arrow__方法控制从 pyarrow 到 pandas ExtensionArray 的转换。此方法接收 pyarrow ArrayChunkedArray作为唯一参数,并预计返回ExtensionArray此 dtype 和传递的值的适当 pandas:

class ExtensionDtype:
    ...

    def __from_arrow__(self, array: pyarrow.Array/ChunkedArray) -> ExtensionArray:
        ...

请参阅Arrow 文档了解更多信息。

这些方法已针对 pandas 中包含的可空整数和字符串扩展数据类型实现,并确保与 pyarrow 和 Parquet 文件格式的往返。

子类化 pandas 数据结构#

警告

pandas在考虑子类化数据结构之前,有一些更简单的选择。

  1. 带管道的可扩展方法链

  2. 使用组合。看这里

  3. 通过注册访问器进行扩展

  4. 扩展类型扩展

本节介绍如何对pandas数据结构进行子类化以满足更具体的需求。有两点需要注意:

  1. 覆盖构造函数属性。

  2. 定义原始属性

笔记

你可以在geopandas项目中找到一个很好的例子。

覆盖构造函数属性#

每个数据结构都有多个构造函数属性,用于返回新的数据结构作为操作的结果。通过重写这些属性,您可以通过pandas数据操作保留子类。

子类上可以定义 3 种构造函数属性:

  • DataFrame/Series._constructor:当操作结果与原始尺寸相同时使用。

  • DataFrame._constructor_slicedDataFrame:当(子)类操作结果应该是(子)类时使用Series

  • Series._constructor_expanddimSeries:当(子)类操作结果应该是(子)类时使用DataFrame,例如Series.to_frame()

下面的示例展示了如何定义SubclassedSeriesSubclassedDataFrame重写构造函数属性。

class SubclassedSeries(pd.Series):
    @property
    def _constructor(self):
        return SubclassedSeries

    @property
    def _constructor_expanddim(self):
        return SubclassedDataFrame


class SubclassedDataFrame(pd.DataFrame):
    @property
    def _constructor(self):
        return SubclassedDataFrame

    @property
    def _constructor_sliced(self):
        return SubclassedSeries
>>> s = SubclassedSeries([1, 2, 3])
>>> type(s)
<class '__main__.SubclassedSeries'>

>>> to_framed = s.to_frame()
>>> type(to_framed)
<class '__main__.SubclassedDataFrame'>

>>> df = SubclassedDataFrame({"A": [1, 2, 3], "B": [4, 5, 6], "C": [7, 8, 9]})
>>> df
   A  B  C
0  1  4  7
1  2  5  8
2  3  6  9

>>> type(df)
<class '__main__.SubclassedDataFrame'>

>>> sliced1 = df[["A", "B"]]
>>> sliced1
   A  B
0  1  4
1  2  5
2  3  6

>>> type(sliced1)
<class '__main__.SubclassedDataFrame'>

>>> sliced2 = df["A"]
>>> sliced2
0    1
1    2
2    3
Name: A, dtype: int64

>>> type(sliced2)
<class '__main__.SubclassedSeries'>

定义原始属性#

为了让原始数据结构具有附加属性,您应该pandas知道添加了哪些属性。pandas将未知属性映射到覆盖的数据名称__getattribute__。可以通过以下两种方式之一定义原始属性:

  1. 定义_internal_names_internal_names_set为不会传递到操作结果的临时属性。

  2. 定义_metadata将传递给操作结果的普通属性。

下面是定义两个原始属性的示例,“internal_cache”作为临时属性,“added_property”作为普通属性

class SubclassedDataFrame2(pd.DataFrame):

    # temporary properties
    _internal_names = pd.DataFrame._internal_names + ["internal_cache"]
    _internal_names_set = set(_internal_names)

    # normal properties
    _metadata = ["added_property"]

    @property
    def _constructor(self):
        return SubclassedDataFrame2
>>> df = SubclassedDataFrame2({"A": [1, 2, 3], "B": [4, 5, 6], "C": [7, 8, 9]})
>>> df
   A  B  C
0  1  4  7
1  2  5  8
2  3  6  9

>>> df.internal_cache = "cached"
>>> df.added_property = "property"

>>> df.internal_cache
cached
>>> df.added_property
property

# properties defined in _internal_names is reset after manipulation
>>> df[["A", "B"]].internal_cache
AttributeError: 'SubclassedDataFrame2' object has no attribute 'internal_cache'

# properties defined in _metadata are retained
>>> df[["A", "B"]].added_property
property

绘制后端#

pandas 可以通过第三方绘图后端进行扩展。主要思想是让用户选择一个与基于 Matplotlib 提供的绘图后端不同的绘图后端。例如:

>>> pd.set_option("plotting.backend", "backend.module")
>>> pd.Series([1, 2, 3]).plot()

这或多或少相当于:

>>> import backend.module
>>> backend.module.plot(pd.Series([1, 2, 3]))

然后,后端模块可以使用其他可视化工具(Bokeh、Altair...)来生成绘图。

实现绘图后端的库应该使用入口点 来使 pandas 可以发现其后端。关键是"pandas_plotting_backends"。例如,pandas 注册默认的“matplotlib”后端,如下所示。

# in setup.py
setup(  # noqa: F821
    ...,
    entry_points={
        "pandas_plotting_backends": [
            "matplotlib = pandas:plotting._matplotlib",
        ],
    },
)

有关如何实现第三方绘图后端的更多信息可以在 pandas-dev/pandas中找到。

与第 3 方类型的算术#

为了控制自定义类型和 pandas 类型之间算术的工作方式,请实现__pandas_priority__.与 numpy 的语义类似,如果、和对象具有更高值的属性,则 、 和 对象__array_priority__ 上的算术方法 将委托给, 。DataFrameSeriesIndexother__pandas_priority__

默认情况下,pandas 对象会尝试与其他对象进行操作,即使它们不是 pandas 已知的类型:

>>> pd.Series([1, 2]) + [10, 20]
0    11
1    22
dtype: int64

在上面的例子中,如果是一个可以理解为列表的自定义类型,pandas 对象仍然会以相同的方式对其进行操作。[10, 20]

在某些情况下,将操作委托给其他类型很有用。例如,假设我实现了一个自定义列表对象,并且我希望使用 pandas 添加自定义列表的结果Series是我的列表的实例,而不是Series前面示例中所示的 a。现在可以通过定义__pandas_priority__自定义列表的属性并将其设置为比我要操作的 pandas 对象的优先级更高的值来实现。

__pandas_priority__DataFrameSeriesIndex分别是、400030002000。基地ExtensionArray.__pandas_priority__1000.

class CustomList(list):
    __pandas_priority__ = 5000

    def __radd__(self, other):
        # return `self` and not the addition for simplicity
        return self

custom = CustomList()
series = pd.Series([1, 2, 3])

# Series refuses to add custom, since it's an unknown type with higher priority
assert series.__add__(custom) is NotImplemented

# This will cause the custom class `__radd__` being used instead
assert series + custom is custom